非洲猪瘟病毒（ASFV）是严重和高度传染性猪病毒病的病原体，其高死亡率和对国际贸易的影响对生猪产业造成了严重的经济损失。目前没有控制非洲猪瘟（ASF）的有效疫苗，因此，ASFV的早期发现和诊断对非洲猪瘟防控至关重要。

  从历史上看，ASFV基因组的巨大（ 180 kB）曾是快速获得完整基因组序列的障碍因素。快速采集数据对于鉴定分离株和支持流行病学研究至关重要。美国农业部国家兽医服务实验室O’Donnell等人研究了牛津纳米粒子序列传感设备充当快速测序工具的能力，结合其配套软件——非洲猪瘟快速分析测序工具（ASF-FAST），对输出数据进行了实时分析。

  该文章着重介绍了将纳米孔测序技术与ASF-FAST软件结合使用的目的，以快速、实时地从诊断样品中分离出完整的ASFV基因组。输出数据的分析是实时进行的。完整的ASFV基因组序列是从细胞培养分离株和实验感染的猪获得的血样中产生的。从提取的核酸中去除宿主甲基化的DNA有助于快速进行ASFV序列鉴定，在测序开始后的6分钟内可以检测到ASFV特异的读数。不论起始材料如何，都可在10分钟内获得足够的序列用于完整的基因组分析（高达100％）。

  这项工作演示了纳米孔测序技术技术在基于序列的诊断方面的效用，以便在疾病暴发时为有效应急管理供技术支持。

《中国动物保健》周盼伊翻译整理

(责任编辑：乔春玲)