腹泻仔猪中猪圆环病毒2型的检测及生物信息学分析
投稿时间:2017-06-27  
DOI:
中文关键词:  猪圆环病毒2型  PCR检测  生物信息学分析
英文关键词:
基金项目:四川省科技支撑计划(2014NZ0043;2015NZ0072)
作者单位
平措 四川农业大学动物医学院, 四川 成都 611130
西藏林芝市巴宜区农牧局兽防站, 西藏 林芝 860100 
许思遥 四川农业大学动物医学院, 四川 成都 611130 
徐志文 四川农业大学动物医学院, 四川 成都 611130 
朱玲 四川农业大学动物医学院, 四川 成都 611130 
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中文摘要:
      为研究仔猪腹泻中猪圆环病毒2型(PCV2)的生物信息,参考GenBank发表的猪圆环病毒2型(PCV2)全基因组序列,设计并合成一对特异性引物,从四川地区猪场送检的腹泻仔猪病料中扩增PCV2全长基因序列,回收PCR产物。将其插入PMD19-T载体,构建了重组质粒,转化后筛选、提取阳性重组质粒进行测序。将测序结果及推导的氨基酸序列与国内外的不同分离株进行生物信息学分析。结果表明,分离株基因组全长为1 767 bp,分离的三株基因组与GenBank上已发表的PCV2分离株之间的核苷酸同源性分别为1#94.7%~89.6%、2#94.7%~89.3%、3#96.4%~86.8%,氨基酸序列同源性为1#97.9%~95.7%、2#97.1%~95.5%、3#98.4%~94.8%,说明四川地区腹泻仔猪病料中PCV2的变异相对保守。
英文摘要:
      
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