乙型脑炎病毒分离株PrM/E基因测序和SA14、SA14-14-2的序列比较
投稿时间:2008-11-22  
DOI:
中文关键词:  日本乙型脑炎病毒  PrM/E基因克隆  核酸序列
英文关键词:
基金项目:2006年贵州省高层次人才科研条件特助经费项目资助,编号:TZJF-2006年01号。
作者单位
汤德元  
徐健  
曾智勇  
黄涛  
李春燕  
李佳蔚 贵州大学动物科学学院, 贵州贵阳 550025 
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中文摘要:
      该研究通过RT-PCR扩增乙型脑炎病毒分离株PrM/E基因测序后,将测序结果与GenBanK发表的JEV SA14基因序列和SA14-14-2进行比较分析,结果发现分离株与JEV SA14强毒株的同源性为98.1%,与SA1-14-2株的同源性为97.1%;在477-2477长为2000nt决定JEV抗源性的PrM/E区中,分离株与SA14株仅有40个碱基不同,其中12个碱基为错义突变,导致E基因2个氨基酸序列(E135和E232)与SA14的E区两个氨基酸的不同;而分离株与SA14-14-2株有48个碱基不同,导致E基因12个氨基酸序列与SA14-14-2不同。由于确定JEV毒性的10个关键性基酸的位置均在E蛋白上,分离株与SA14强毒株这10个氨基酸的位置完全一致,因此序列的比较结果表明;乙脑病毒分离株为强毒株。由此可以看出基因分析对于病毒毒力的判断具有重要参考意义。
英文摘要:
      
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