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| 副猪嗜血杆菌OMP5 基因的克隆及生物信息学分析 |
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| 投稿时间：2013-03-21 |
| DOI： |
| 中文关键词: 副猪嗜血杆菌 OMP5 基因 克隆 生物信息学分析 |
| 英文关键词: |
| 基金项目:贵州省2011 年农业攻关项目资助[编号：黔科合NY字（2011）3103号]；贵州省2010 年农业科技攻关项目[编号：黔科合NY字（2010）3042号] |
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| 中文摘要: |
| 根据GenBank 上公布的副猪嗜血杆菌外膜蛋白OMP5 基因的核苷酸序列，设计1 对特异性引物，对贵州省HPS 分离株OMP5 基因进行扩增。结果表明所扩增的OMP5 基因的长度为1116 bp，与SH0165 株对应的核苷酸序列和氨基酸同源性均为100%。生物信息学分析结果表明，OMP5 基因所编码的外膜蛋白P5 的理论等电点pI为9.34，不稳定系数为20.44，推测其为稳定性蛋白；脂肪指数为83.94，总体平均亲水性为-0.172，推测该蛋白是一种亲水性蛋白；该蛋白含有丰富的α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲，无跨膜区，最前端的21 个N-末端氨基酸残基为信号肽序列并且主要为疏水性氨基酸，最佳切割位点在第21～22 个氨基酸之间；结构位点预测表明该蛋白含有多个不同的糖基化和磷酸化位点。 |
| 英文摘要: |
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